بدأ الخلاف بين الجامعة والمحافظة على ترخيص مبنى المستشفى الجامعي الكائن داخل الحرم الجامعي فمجلس مركز ومدينة كفر الشيخ برئاسة اللواء أحمد الطرابلسي رئيس مركز ومدينة كفر الشيخ رفع تقريرا للدكتور أسامه حمدي محافظ كفر الشيخ أكد فيه الطرابلسي  أن هناك لجنة من مجلس المدينة  عاينت مبنى المستشفى الجامعي الواقع داخل مبنى جامعة كفر الشيخ  وتبين أن الجامعة لم تحصل على  ترخيص لبناء المستشفى الجامعي من مجلس المدينة

وأضاف التقرير أن قطعة الأرض التي بني عليها المستشفى الجامعي مرخصة كنزل شباب وأن الأمر مخول للدكتور أسامه مدي محافظ كفر الشيخ لاتخاذ ما يراه مناسباً في هذا الشأن .

ومن جانبه أكد الدكتور ماجد القمري رئيس جامعة كفر الشيخ  أن  ترخيص قطة الأرض نزل شباب ولكن مجلس الجامعة انعقد وقرر تغيير نشاط المبنى وهذا من اختصاصات مجلس الجامعة على غرار مجالس الجامعات الاخري التي من غيرها تغيير الاختصاص منها جامعة عين شمس وغيرها من الجامعات مادام المبنى داخل الحرم الجامعي مشيراً أيهما أولى نزل الشباب أم المستشفى الجامعي التي تعالج الملايين من الإمراض المتعددة ؟

وأضاف أن الملايين من أبناء المحافظة والمحافظات المجاورة تنتظر بفارغ الصبر افتتاح المستشفى الجامعي لتلقى العلاج فيه